问题 | 原因 | 解决办法 |
DNA带模糊 | DNA降解 | 避免核酸酶污染 |
电泳缓冲液陈旧
| 电泳缓冲液多次使用后,离子强度降低,pH值上升,缓冲能力减弱,从而影响电泳效果。建议经常更换电泳缓冲液 | |
所用电泳条件不合适 | 电泳时电压不应超过20V/cm,温度<30℃;巨大DNA链电泳, 温度应<15℃;核查所用电泳缓冲液是否有足够的缓冲能力 | |
DNA上样量过多 | 减少凝胶中DNA上样量 | |
DNA样含盐过高 | 电泳前通过乙醇沉淀去除过多的盐 | |
有蛋白污染 | 电泳前酚抽提去除蛋白 | |
DNA变性 | 电泳前勿加热,用20mM NaCl缓冲液稀释DNA | |
不规则DNA带迁移 | 对于λ/Hind III片段cos位点复性 | 电泳前于65℃加热DNA 5分钟,然后在冰上冷却5分钟 |
电泳条件不合适 | 电泳电压不超过20V/cm;温度<30℃;经常更换电泳缓冲液 | |
DNA变性 | 以20mM NaCl Buffer稀释DNA,电泳前勿加热 | |
带弱或无DNA带 | DNA的上样量不够 | 增加DNA的上样量;聚丙烯酰胺凝胶电泳比琼脂糖电泳 灵敏度稍高,上样量可适当降低 |
DNA降解 | 避免DNA的核酸酶污染 | |
DNA走出凝胶 | 缩短电泳时间,降低电压,增强凝胶浓度 | |
对于EB染色的DNA,所用光源不合适 | 应用短波长(254nm)的紫外光源 | |
DNA带缺失 | 小DNA带走出凝胶 | 缩短电泳时间,降低电压,增强凝胶浓度 |
分子大小相近的DNA带不易分辨 | 增加电泳时间,核准正确的凝胶浓度 | |
DNA 变性 | 电泳前请勿高温加热DNA链,以20mM NaCl Buffer稀释DNA | |
DNA链巨大 | 常规凝胶电泳不合适 在脉冲凝胶电泳上分析 |